Согласно документу, молдавское правительство не упразднило предыдущие постановления об отказе в регистрации некоторым религиозным культам. "Несмотря на отсуствие госуарственной религи, Митрополия Молдовы пользуется привилегированным отношением со стороны правительства... Руководство этой митрополии и другие представители этого культа располагают дипломатическими паспортами, выданными правительством". Митрополия Молдовы пользуется также приоритетом при реституции имущества, конфискованного бывшим коммунистическим режимом, или при установлении компенсаций за понесенный ущерб в советский период.

Между различными культами, в целом, царит веротерпимость, а наиболее частные разногласия возникают между двумя православными христианскими митрополиями (Митрополией Молдовы и Митрополией Бессарабии - прим. ред.).

В докладе отмечается, что законодательство Республики Молдова предусматривает обязательную регистрацию всех култьтов и религиозных общин. В противном случае, они не имеют права на собственность, на зачисление на работу персонала, на участки на государственных кладбищах под своим именем.

Вместе с тем, молдавские законы запрещают регистрацию "раскольнических движений" существующих культов на территории страны, что позволяет правительству не признавать некоторые религиозные организации, к примеру, Митрополию Бессарабии, которая добилась регистрации более чем через 10 лет после подачи первого ходатайства и лишь после обращения в Европейский суд по правам человека.

Нарушением норм международного права стала попытка исключить из парламента одного из членов оппозиции, который открыто поддерживает Митрополию Бессарабии - Влада Кубрякова. Коммунистическое парламентское большинство обвинило Влада Кубрякова в том, что он является советником в "антиконституционной структуре". Позже Кубряков был похищен и многие аналитики предположили, что его исчезновение связано с его активной поддержкой Митрополии Бессарабии.

Авторы доклада констатируют, что "в сепаратистском регионе Приднестровье местная администрация продолжает отказывать в регистрации многим религиозным меньшинствам и в некоторых случаях прибегает к гонениям некоторых из них", в частности, сект баптистов, иеговистов, методистов, адвентистов и пр.

В апреле 2001 года епископ тираспольский Юстиниан воспользовался военизированными формировавними, чтобы вторгнуться в Новонямецкий монастырь в Кицкань и занять место ректора местной Духовной семинарии. Позже конфликт был разрешен путем восстановления митрополита Владимира в этой должности и перевода семинарии в Кишинев, отмечается в отчете.

Документ свидетельствует также о том, что в Республике Молдова нет заключенных или пленных по религиозным убеждениям и не было случаев насильного обращения из одной веры в другую.

90% населения страны являются православными христианами, остальную часть составляют представители Римско-католической Церкви, баптисты, пятидесятники, мусульмане, иудеи, иеговисты, лютеране, кришнаиды, мормоны и др.