Явлинский и Путин особенно сблизились в момент, когда разворачивалась драма с заложниками. Президент подключил к разрешению ситуации в качестве посредника Явлинского, который в силу своей последовательной критики чеченской войны пользуется на Кавказе относительно высоким доверием. По поручению Путина Явлинский разработал совместно с главой администрации президента Волошиным сценарий освобождения заложников. Концепция Явлинского была, в частности, позже отвергнута, но Путин неожиданным образом все же похвалил своего вечного оппонента такими словами: "Нам есть кое-что сказать друг другу".

Явлинский в своих аналитических материалах рисует для российского президента мрачную картину экономического и политического давления обстоятельств. По его словам, экономическая система, возникшая при Ельцине, в настоящее время, конечно, стабилизировалась. Но вследствие того, что на 50 процентов она находится в зависимости от экспорта нефти и природного газа, система эта может очень быстро оказаться в состоянии еще более глубокого системного кризиса. Правительство Касьянова полностью исчерпало себя, продолжает он. Экономика и государство жили не по праву и закону, а по праву сильного, на основе наличия личных отношений и в условиях постоянно меняющихся договоренностей. Эта система, по мнению политика, может, конечно, быть стабильной, но в итоге Россия обречена на "демодернизацию". Путина "привела к власти конкретная группа, связанная политическими, экономическими и корпоративными интересами, с которой он обязан проявлять солидарность". Но он, тем не менее, представляет собой постоянную "потенциальную угрозу для элиты и ее режима".

Российский президент начинает неизбежно воспринимать себя в окружении стен Кремля государственным мужем, говорит Явлинский. "В результате появляется носитель общегосударственных интересов и ценностей". Если у Путина "есть мужество, он может действовать решительно". Он может снова вернуть свободу прессе и сформировать правительство, которое не будет обязано корпоративным кланам теневой экономики, с тем, чтобы не допустить, чтобы страна оказалась на задворках мировой цивилизации. Явлинский напоминает о том, что нечто подобное происходило 15 лет назад, когда исчезла тоталитарная система. Это для России, быть может, последний шанс. В настоящее время, заключает Явлинский, альтернативы надежде на "доброго царя" не существует, так как общество слишком слабо, чтобы помочь самому себе.