Шефер начал карьеру баскетболиста в команде "Апоэль" (Гиватайм), затем перешел в "Апоэль" (Верхняя Галилея). В составе этой команды, которую тренировал тогда Пини Гершон, Шефер стал чемпионом страны сезона 1992-93 гг. Три сезона он играл за команду колледжа штата Коннектикут, участвовал в турнирах вместе с многими звездами НБА.

Вернувшись в Израиль, играл за тель-авивский "Маккаби", в составе которого стал многократным чемпионом страны и финалистом чемпионата Европы. Кстати, после проигрыша в финале ЧЕ-2000 греческому "Панатинаикосу" впервые уведомил израильскую Федерацию баскетбола, что намерен оставить спорт.

Около двух лет болельщики не видели Шефера на площадке. В этот период у него было обнаружено онкологическое заболевание, но он сумел победить болезнь.

А в 2002 году неожиданно вернулся в большой баскетбол. Сначала полсезона играл за родной тель-авивский "Маккаби", не вызывая особого восторга у болельщиков, но затем – уже в иерусалимском "Апоэле" он снова заблистал, приведя команду в сезоне 2002-3 гг. ко многим высоким достижениям как в стране, так и в Европе.

Последний свой сезон 33-летний Шефер провел в тель-авивском клубе "Апоэль".