Внешние изменения не так велики – появились хромированные элементы отделки передка, новая биксеноновая оптика и жидкокристаллические габаритные огни, автоматически зажигающиеся, как только начинает работать двигатель. Основные же перемены коснулись технической "начинки" автомобиля.

Так, впервые в модельном ряду Volkswagen появился дизельный двигатель, удовлетворяющий экологическим стандартам Евро-5, которые вступят в силу в 2009 году. V-образная турбированная "шестерка" имеет мощность 233 л. с. и разгоняет Phaeton до 236 км/ч, потребляя при этом всего 9,6 литров топлива на 100 км. Второе техническое новшество – системы Front Assist и Side Assist. Первая из них направлена на то, чтобы снизить риск столкновения с идущей впереди машиной. Специальный радар замеряет дистанцию, и если та становится опасно маленькой, система сначала предупреждает водителя, а затем, если тот не сориентировался, самостоятельно начинает торможение. Side Assist помогает перестраиваться из ряда в ряд, избегая боковых столкновений. Здесь тоже имеется свой радар, измеряющий расстояния до машин на соседних полосах движения.

Серийное производство обновленного Volkswagen Phaeton начнется в конце мая 2007 года.